78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2541 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  48.47 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  50.51 
 
 
243 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  47.25 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  41.71 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  40.1 
 
 
658 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  43.43 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  38.05 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  39.27 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.18 
 
 
250 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  37.44 
 
 
233 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  37.97 
 
 
231 aa  92  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  40.52 
 
 
238 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  34.67 
 
 
252 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  40.83 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  41.28 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  38.79 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  34.58 
 
 
234 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  34.66 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  34.66 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  38.07 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  38.94 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  38.34 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  37.82 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  38.34 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  38.46 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  37.98 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  34.59 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  34.93 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  36.32 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  36.65 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  36.65 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  29.86 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  31.28 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  32.27 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  24.41 
 
 
227 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  33.54 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  35.81 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  31.68 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  33.55 
 
 
289 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  30.46 
 
 
239 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  26.17 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  35.76 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  35.76 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  35.76 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  25.88 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  32.21 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  32.21 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  30.57 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  29.75 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  30.57 
 
 
230 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  25.23 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  43.24 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  32.21 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  37.8 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  24.19 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  30.52 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  32.61 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  28.76 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  32.61 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  30.25 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  32.61 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  32.61 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  32.61 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  32.61 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  27.45 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  32.61 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  26.8 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  26.8 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  26.8 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  27.18 
 
 
220 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  29.87 
 
 
273 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  21.86 
 
 
225 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  32.03 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  24.26 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>