29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1457 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  56.9 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  36.56 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  32.11 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  31.61 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  30.11 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  34.71 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  28.77 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  33.51 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  33.15 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  29.3 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  29.77 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  32.81 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  28.73 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  27.59 
 
 		 658 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  30.3 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  31.49 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  26.98 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  28.36 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  30.27 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  30.27 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  27.72 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  29.05 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  28.65 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  27.14 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  29.08 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  29.08 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  28.15 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>