47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3558 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  93.65 
 
 		 252 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  68.29 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  68.26 
 
 		 231 aa  295  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  67.36 
 
 		 264 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  35.38 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  36.53 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  34.98 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  36.53 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.64 
 
 		 658 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  34.15 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  35.58 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  32.95 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  35.22 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  34.52 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  34.92 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  31.56 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  32.27 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  36.1 
 
 		 214 aa  72  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  31.82 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  35.78 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  37.13 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  32 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  35.78 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  30.05 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  32.22 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  30.77 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  29.84 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  27.78 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  31.31 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  26.42 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  24.76 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  29.63 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  25.35 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  26.51 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  23.98 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  31.31 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  29.09 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.37 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  24.85 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  35.62 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  26.73 
 
 		 227 aa  42  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>