42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4372 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  87.44 
 
 		 240 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  46.64 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  48.57 
 
 		 209 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  51.17 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  49.34 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  50.96 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  48.67 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  52.74 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  48.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.93 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  32.22 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  37.43 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  32.45 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  34.73 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  32 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  33.73 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  34.59 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  32.02 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  35.22 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  31.96 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.43 
 
 		 658 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  31.46 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  31.31 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  30.95 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  29.55 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  29.89 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.44 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  28.29 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  27.06 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  28.1 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  28.74 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  23.04 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  30 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  28.48 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  25.45 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  26.85 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.85 
 
 		 231 aa  42  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>