43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5273 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  50.51 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  52.22 
 
 		 212 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  48.31 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  45.3 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  44.26 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  43.72 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  44.57 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  39.41 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  43.93 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  39.23 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  40.21 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  35.84 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  33.02 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  39.06 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  34.82 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  35.45 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  37.33 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  36.87 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  37.2 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  36.61 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  36.9 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.4 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  38.17 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  34.09 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  31.79 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  31.6 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  37.82 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  33.89 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  38.14 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  28.16 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  34.05 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  38.14 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  30.2 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  31.82 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.79 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  32.04 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  31.49 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  31.49 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  25.81 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  27.69 
 
 		 264 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>