30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0137 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  99.11 
 
 
224 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  45.16 
 
 
219 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  34.45 
 
 
273 aa  99.4  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  37.11 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  38.6 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  35.06 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0701  hypothetical protein  62.82 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  33.49 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  37.36 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  33.51 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  28.99 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04855  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07550)  30.33 
 
 
331 aa  58.2  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  30.43 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  51.47 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  30.73 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  31.41 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  33.18 
 
 
289 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  34.86 
 
 
238 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  50 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  32.34 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  34.67 
 
 
231 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  21.9 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  30.26 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  30.26 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  34 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  30.37 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  32.56 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>