38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0313 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
225 aa  453  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  47.91 
 
 
225 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  39.19 
 
 
243 aa  170  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  38.07 
 
 
230 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  33.18 
 
 
230 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  31.78 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  32.12 
 
 
203 aa  109  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  32.88 
 
 
225 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  31.65 
 
 
219 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  31.13 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  31.13 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  31.6 
 
 
232 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  32.21 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  30.77 
 
 
273 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  31.13 
 
 
248 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  30.77 
 
 
282 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  30.23 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  30.61 
 
 
246 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  30.61 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  30.1 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  29.25 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  25.73 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  26.7 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  27.32 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  29.23 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  27.23 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  25.93 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  25.23 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  24.6 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  24.27 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  21.08 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  22.53 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  25.39 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  22.1 
 
 
224 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>