34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1257 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  541  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  41.45 
 
 
239 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  36.41 
 
 
224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  35.12 
 
 
224 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  35.12 
 
 
224 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  37.33 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  33.86 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  32.19 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  35.75 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  32.12 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04855  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07550)  32.56 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  28.36 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  41.05 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  28.11 
 
 
196 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  41.33 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  30.7 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  41.18 
 
 
229 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  25.84 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  28.31 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  31.43 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  51.16 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  30.23 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  41.1 
 
 
264 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  26.7 
 
 
228 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  30.62 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  36.67 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  25.42 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  50 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  30.33 
 
 
235 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  29.92 
 
 
235 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  53.85 
 
 
255 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>