16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5622 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 264 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  31.64 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  43.88 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  32.7 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  26.67 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  41.1 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  32.56 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  29.11 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  31.05 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  28.29 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  26.02 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  28.89 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  31.95 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  26.15 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  34.52 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  35.29 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>