56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5806 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  443  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  98.7 
 
 		 230 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  86.54 
 
 		 231 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  85.15 
 
 		 231 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  83.84 
 
 		 231 aa  351  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  83.41 
 
 		 232 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  82.94 
 
 		 232 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  82.94 
 
 		 232 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  57.95 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  51.09 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  51.09 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  51.53 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  53.93 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  43.93 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  43.87 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  42.65 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  42.65 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  44.91 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  42.86 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  40.54 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  41.71 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  31.66 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  31.66 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  37.56 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  33.99 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  37.02 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  37.02 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  37.02 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  31.34 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  38.65 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  35.61 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  36.63 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  32.33 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  29.61 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  30.43 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  30.46 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  27.35 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  30.7 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  33 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  29.51 
 
 		 386 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  29.63 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  42.67 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  26.48 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.23 
 
 		 658 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  31.55 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  32.65 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  32.65 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  27.94 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  32.65 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  37.08 
 
 		 386 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  26.77 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  29.58 
 
 		 214 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  30.14 
 
 		 252 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  29.58 
 
 		 214 aa  42  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>