36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5725 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  71.66 
 
 
245 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  71.66 
 
 
245 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  72.06 
 
 
245 aa  294  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  53 
 
 
230 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  51.69 
 
 
231 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  53.93 
 
 
196 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  52.74 
 
 
230 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  52.31 
 
 
231 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  50.88 
 
 
231 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  52.86 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  52.86 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  52.86 
 
 
232 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  48.86 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  47.3 
 
 
235 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  47.3 
 
 
235 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  45.28 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  46.82 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  47.16 
 
 
238 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  46.23 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  34.26 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  33.33 
 
 
240 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  34.88 
 
 
237 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  38.91 
 
 
229 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  35.03 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  30.95 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  40.52 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  40.31 
 
 
226 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  40.31 
 
 
226 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  37.72 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  38.5 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  36.06 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  34.25 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  26.36 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  30.57 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  30.52 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>