90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1206 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 262 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  65.98 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  67.11 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  65.78 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  65.33 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  63.57 
 
 		 254 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  50.38 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  52.3 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  51.46 
 
 		 386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  51.05 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  48.13 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  52.05 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  51.82 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  45.87 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  47.88 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  49.59 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  49.59 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  50.41 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  47.88 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  47.88 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  49.79 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  49.37 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  49.37 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  49.37 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  47.72 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  47.72 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  48.74 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  54.13 
 
 		 386 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  48.16 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  49.34 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  35.62 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  37.02 
 
 		 232 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  37.62 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  42.7 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  34.91 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  42.03 
 
 		 154 aa  87  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  37.29 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  29.78 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  31.48 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  26.89 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  28.81 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.54 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  29.95 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  29.88 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  26.14 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  29.24 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  28.88 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  30.77 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  27.24 
 
 		 658 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  32.32 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  27.76 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  32.47 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  32.22 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  32.43 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  26.27 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  31.67 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.31 
 
 		 209 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  30.97 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  28.85 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  31.13 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  32.2 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  27.68 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  33.14 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  26.69 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  28.85 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  26.38 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  27.48 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  26.38 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  31.11 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  34.02 
 
 		 236 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  32.19 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  24.17 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  25.45 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  26.76 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  29.13 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  32.3 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  32.3 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  30.51 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  27.22 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  32.3 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  28.23 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>