65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4780 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 247 aa  493  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 247 aa  493  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  84.55 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  64.52 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  62.35 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  63.16 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  65.46 
 
 		 252 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  65.46 
 
 		 252 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  64.37 
 
 		 386 aa  304  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  66.39 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  66.39 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  63.56 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  65.98 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  65.06 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  65.98 
 
 		 257 aa  298  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  64.26 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  63.89 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  63.49 
 
 		 252 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  65.59 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  64.37 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  54.51 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  59.43 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  62.44 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  57.69 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  53.57 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  57.71 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  56.89 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  56.89 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  47.72 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  54.96 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  51.2 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  38.1 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  33.04 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  39.52 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  44.37 
 
 		 154 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  39.58 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  45.45 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  29.79 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  31.9 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  33.47 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  29.24 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  31.47 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  33.78 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  34.11 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  30.94 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.74 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  30.26 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  34.34 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  35.93 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  29.72 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  30.59 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.77 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  27.75 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  29.36 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  27.5 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  27.48 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  29.81 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  26.83 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  28.94 
 
 		 235 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  28.94 
 
 		 235 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  28.44 
 
 		 252 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  28.44 
 
 		 252 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  28.66 
 
 		 228 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>