60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2095 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  64.81 
 
 
222 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  61.99 
 
 
222 aa  260  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  55.3 
 
 
220 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  58.82 
 
 
220 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  54.91 
 
 
223 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  57.14 
 
 
215 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  47.42 
 
 
222 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  41.96 
 
 
231 aa  158  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  41.52 
 
 
224 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  42.41 
 
 
231 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  36.68 
 
 
227 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  33.17 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  34.8 
 
 
386 aa  75.1  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  32.72 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  35 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  34.48 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  40.38 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  35.44 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  31.56 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  31.16 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  30.97 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  34.74 
 
 
386 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  32.84 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  33.49 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  35.15 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  30.14 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  30.5 
 
 
265 aa  52.4  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  29.61 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  30.5 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  28.77 
 
 
256 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  32.71 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  31.1 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  32.71 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  32.71 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  32.42 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  28.7 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  32.58 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  28.7 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  31.36 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  40.74 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  31.37 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  41.03 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  64.71 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  36.77 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  36.77 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  33.12 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  35.06 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  42.11 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  36.77 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  29.27 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.37 
 
 
658 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  29.13 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.85 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  28.57 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  28.64 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  30.11 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  46.43 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  58.33 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  30.85 
 
 
233 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>