60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1532 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  51.03 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  35.19 
 
 		 386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  35.1 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  29.84 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  34.7 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  30.67 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  32.89 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  31.48 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  33.88 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  34.7 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  32.31 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  32.31 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  33.49 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  31.65 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  31.65 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  32.08 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  37.36 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  32.08 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  32.08 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  31.74 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  31.65 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  33.04 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  32.17 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  34.91 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  34.21 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  34.63 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  31.74 
 
 		 252 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  34.81 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  35.51 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  35.33 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  34.6 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  32.51 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  32.34 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  31.63 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  41.06 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  27.46 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  32.68 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  25.53 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  48.68 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  25.11 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.27 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  38.3 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  29.38 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  28.77 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  62.16 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  40.74 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  31.82 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  26.25 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  28.3 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  25.62 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  31.21 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  26.26 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  26.74 
 
 		 231 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>