41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1379 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  38.36 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  37.18 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  33.67 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  33.7 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  32.4 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  33.9 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  29.3 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  29.12 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  29.63 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  29.05 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  31.72 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  31.15 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  29.33 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.61 
 
 		 386 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  31.31 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  32.43 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  34.23 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  31.82 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  31.08 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  28.25 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  31.51 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  31.08 
 
 		 253 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  31.17 
 
 		 386 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  29.05 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  30.14 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  25.62 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  33.56 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  29.79 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  31.13 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  32.87 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  32.87 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  32.87 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  32.35 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  27.81 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  27.66 
 
 		 265 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  27.66 
 
 		 265 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.04 
 
 		 243 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>