57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0107 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  32.63 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  29.44 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  29.86 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  28.44 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.59 
 
 		 386 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  28.11 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  28.85 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  34.21 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  29.81 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  28.7 
 
 		 386 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  26.58 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  29.96 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  29.96 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  26.72 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  26.59 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  25.96 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  29.26 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  27.9 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  27.51 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  29.7 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  29.57 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  29 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  29.17 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  26.2 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  29.02 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  26.87 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  25.76 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  28.95 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  26.21 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  28.04 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  27.18 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  24.29 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  31.69 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  29.66 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  27.57 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  31.69 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  24.5 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  26.43 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  25.37 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  25.34 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  26.49 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  23.85 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  24.86 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  25.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  22.28 
 
 		 234 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>