60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7065 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  96.43 
 
 
252 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  96.43 
 
 
252 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  96.83 
 
 
252 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  90.87 
 
 
252 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  90.48 
 
 
252 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  74.8 
 
 
253 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  74.59 
 
 
259 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  75.82 
 
 
253 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  75 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  75 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  75 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  74.59 
 
 
257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  64.26 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  64.26 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  64.58 
 
 
386 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  60.66 
 
 
248 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  65.04 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  56.97 
 
 
253 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  66.27 
 
 
247 aa  278  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  57.61 
 
 
270 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  60.81 
 
 
268 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  62.7 
 
 
386 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  57.36 
 
 
261 aa  235  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  50.41 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  52.78 
 
 
260 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  54.15 
 
 
265 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  54.15 
 
 
265 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  54.55 
 
 
256 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  55.51 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  53.11 
 
 
250 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  39.91 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  40.19 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  32.19 
 
 
283 aa  109  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  42.35 
 
 
250 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  38.21 
 
 
232 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  41.96 
 
 
154 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  40.1 
 
 
244 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  33.71 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  29.76 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  30.8 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  31.09 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  38.22 
 
 
223 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  34.18 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  34.19 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  36.94 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  27.05 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  29.69 
 
 
222 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  31.94 
 
 
222 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  33.91 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  30.33 
 
 
222 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  27.78 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  28.06 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  29.74 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  28.21 
 
 
228 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  32 
 
 
225 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  26.53 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  30.25 
 
 
250 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  31.47 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>