72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1046 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  95.65 
 
 		 231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  70.4 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  40.27 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  38.29 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  39.34 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  45 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  42.18 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  41.96 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  36.95 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  44.52 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  38.36 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  33.16 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  31.95 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  32.84 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  31.34 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  31.7 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  30.77 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  30.77 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  30.92 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.54 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  32.5 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  32 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.75 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  32.05 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  29.72 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  30.11 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  29.72 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  29.56 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  28.22 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  27.35 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  30.77 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  27.35 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  28.77 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  28.22 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  28.77 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  24.76 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  24.76 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  35.76 
 
 		 386 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  30.14 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  29.74 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  27.32 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.67 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  28.84 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  24.89 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  24.76 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  29.21 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  29.21 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  29.71 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  27.39 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  26.97 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  29.21 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  31.17 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  23.58 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  30.34 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  31.4 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  29.46 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44305  predicted protein  26.94 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0648478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  30.88 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  30.52 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.01 
 
 		 658 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  34.64 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  24.75 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  50 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  37.88 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  29.94 
 
 		 261 aa  41.6  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>