70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2051 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0910  hypothetical protein  58.02 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  54.69 
 
 		 253 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  55.1 
 
 		 259 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  55.1 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  56.31 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  58.56 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  51.02 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  56.97 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  55.38 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  55.38 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  54.51 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  54.51 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  54.98 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  55.38 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  56.15 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  54.58 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  54.92 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1260  hypothetical protein  53.47 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1534  hypothetical protein  53.06 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1619  hypothetical protein  53.06 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0111  hypothetical protein  53.06 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  55.86 
 
 		 386 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0243  hypothetical protein  50.88 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2759  hypothetical protein  52.56 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0124  hypothetical protein  54.24 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0167  hypothetical protein  50.44 
 
 		 265 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0185  protein of unknown function DUF1275  50.44 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0567993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  45.87 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  47.72 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  50.26 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  35.62 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  32.89 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0591  hypothetical protein  39.23 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02910  Protein of unknown function (DUF1275)  38.03 
 
 		 154 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2916  protein of unknown function DUF1275  33.18 
 
 		 235 aa  92  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  37.1 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5436  protein of unknown function DUF1275  36.32 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4446  hypothetical protein  29.21 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  30.84 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  27.17 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  31.84 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  31.42 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  31.34 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001425  predicted membrane protein  33.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00453173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3646  hypothetical protein  27.69 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  31.37 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  31.63 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  31.17 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  28.5 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0240  membrane protein  32.24 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  29.26 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  27.14 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  26.27 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  27.54 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  25.62 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  34.59 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  29.27 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  34.59 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  29.26 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  30.86 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  27.54 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  26.13 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  24.85 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  27.16 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  24.85 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  28.06 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  26.51 
 
 		 252 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>