53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2609 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
238 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  43.22 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  39.8 
 
 
658 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  45.88 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  28.21 
 
 
227 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  42.99 
 
 
224 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  39.89 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  39.89 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  38.79 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  38.54 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  39.55 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  38.8 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  39.55 
 
 
224 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  42.39 
 
 
215 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  35.58 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  37.2 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  35.58 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  38.61 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  35.58 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  43.1 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  35.38 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  38.76 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  37.72 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  37.72 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  36.56 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  36.65 
 
 
264 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  36.75 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  34.83 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  33.53 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  38 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  31.03 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  29.28 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  31.4 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  31.84 
 
 
240 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  30.97 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  30.39 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  30.36 
 
 
289 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  26.17 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.27 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  26.56 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  30.12 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  27.42 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  26.38 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  30.38 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  27.68 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  26.53 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  27.16 
 
 
253 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  25.79 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  31.51 
 
 
239 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  45.24 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  35.03 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>