49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1238 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.22 
 
 		 658 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0897  hypothetical protein  31.52 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526776  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  28.49 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  27.51 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  29.38 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.4 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  26.02 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  24.6 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  27.81 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  26.63 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  25.57 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  28.43 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  30.67 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  31.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  28.78 
 
 		 264 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  26.42 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  24.56 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  29.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  26.44 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  26.32 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  30.37 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  27.32 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  26.13 
 
 		 273 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  26.13 
 
 		 282 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  25.13 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  23.66 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  25.87 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  21.08 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  26.32 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  25.87 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  24.29 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  23.66 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  27.66 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  29.61 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  23.12 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  25.7 
 
 		 232 aa  42  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  24.87 
 
 		 220 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  42.42 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>