39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3012 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  98.73 
 
 
246 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  98.31 
 
 
246 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  93.22 
 
 
246 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  83.8 
 
 
282 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  79.31 
 
 
232 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  83.11 
 
 
248 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  82.87 
 
 
273 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  82.65 
 
 
248 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  82.19 
 
 
248 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  77.45 
 
 
236 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  48.37 
 
 
236 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  34.07 
 
 
243 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  30.7 
 
 
225 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  35.23 
 
 
225 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  27.64 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  28.64 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  28.67 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  28.86 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  30.61 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  29.3 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  26.27 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  22.12 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  24.88 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  23.74 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  24.62 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  34.48 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  24.89 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  34.31 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  38.46 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  23.5 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  35 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  30 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  34.65 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>