66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3258 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  39.19 
 
 
225 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  39.73 
 
 
225 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  38.99 
 
 
236 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  35.68 
 
 
230 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  37.07 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  38.05 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  37.07 
 
 
248 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  36.59 
 
 
273 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  37.07 
 
 
248 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  37.07 
 
 
248 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  36.04 
 
 
246 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  35.02 
 
 
230 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  36.04 
 
 
237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  36.04 
 
 
246 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  35.53 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  35.53 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  35.53 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  35.53 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  35.53 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  37.85 
 
 
225 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  32.99 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  25.35 
 
 
219 aa  89  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  29.55 
 
 
232 aa  85.1  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  25.68 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  24.79 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  25.52 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  27.84 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  24.08 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  24.19 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  24.4 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  26.51 
 
 
249 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  25.42 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  28.32 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  26.37 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  29.65 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  24.31 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  24.31 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  27.8 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  22.54 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  24.86 
 
 
658 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  32.67 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  25.58 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  26.53 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  22.39 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  40.3 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  28.77 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  30.2 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  28.48 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  24.34 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  24.66 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  26.17 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  24.86 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  29.22 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  29.22 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  29.22 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  26.54 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  24.37 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  24.37 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  24.57 
 
 
240 aa  42  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  24.04 
 
 
214 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  25.84 
 
 
245 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  25.84 
 
 
245 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>