30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_2000 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  43.84 
 
 
231 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  29.41 
 
 
230 aa  101  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  28.85 
 
 
219 aa  99  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  32.84 
 
 
227 aa  89  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  29.25 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  29.65 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.79 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  28.86 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  30.22 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  29.67 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  26.77 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  27.5 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  27.5 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  26.37 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  22.17 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  28.47 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  29.38 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  26.5 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  26 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  28.49 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  25.66 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  20.95 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  22.82 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>