31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0874 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  38.83 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  37.85 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  32.88 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  35.64 
 
 		 273 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  35.82 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  35.75 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  35.75 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  36.14 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  35.47 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  31.09 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  35.23 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  35.23 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  35.23 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  35.23 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  35.47 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  37.17 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  35.23 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  36.14 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  34.98 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  29.56 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  29.44 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  29.78 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  25.64 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  28.42 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  30.09 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  28.87 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  28.47 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  28.47 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  26.06 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  21.65 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>