27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2169 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2169  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  40.62 
 
 
228 aa  168  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  30.32 
 
 
232 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  30.14 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  32.79 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  24.52 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  27.01 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  26.44 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  23.74 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  23.35 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  27.59 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  24.46 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  23.15 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  23.91 
 
 
237 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  23.91 
 
 
246 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  25.93 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  24.52 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  21.98 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  24.52 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  23.65 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  23.11 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  27.94 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  22.5 
 
 
246 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>