36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2359 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  178  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  38.46 
 
 
219 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  33.85 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  36.84 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  32.84 
 
 
227 aa  89  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  29.23 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  30.09 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  27.84 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  27.42 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  27.14 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  27.23 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  25.69 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  25.69 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  26.73 
 
 
273 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  25.69 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  29.69 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  26.29 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  26.85 
 
 
282 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  26.42 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  27.46 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  25.82 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  25.77 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  28.26 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  27.27 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  31.46 
 
 
241 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  38.2 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  31.11 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  24.86 
 
 
250 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  27.5 
 
 
264 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>