36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3009 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  99.6 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  99.19 
 
 		 248 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  95.5 
 
 		 232 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  89.34 
 
 		 282 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  94.44 
 
 		 273 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  89.74 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  77.24 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  82.14 
 
 		 246 aa  328  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  83.56 
 
 		 237 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  81.7 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  83.11 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  83.11 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  83.11 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  83.11 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  47.93 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  36.71 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  30.7 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  35.64 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  28.64 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  32.21 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  28.77 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  29.66 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  32.49 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  26.89 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  27.5 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  25.69 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  28.03 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  24.38 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  23.98 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  29.61 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  38.37 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  25.87 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  38.67 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  25.12 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>