46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1053 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
239 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  56.3 
 
 
234 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  55.19 
 
 
238 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  56.44 
 
 
229 aa  161  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  46.23 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  38.55 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  36.81 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  36.81 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  42.47 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  34.62 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  32.19 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  34.17 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  41.91 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  34.52 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  30.91 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  38.41 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  48.15 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  30.14 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  31.61 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  31.97 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  34.29 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  50 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  34.48 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  34.48 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  40.58 
 
 
658 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06861  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13060)  27.88 
 
 
256 aa  47  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000108871  hitchhiker  0.00598939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  32.43 
 
 
264 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  34.48 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  32.18 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  37.33 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  23.08 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  31.03 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  33.73 
 
 
236 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  31.51 
 
 
238 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  35.8 
 
 
229 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>