39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2918 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  86.17 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  94.14 
 
 		 248 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  89.66 
 
 		 232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  93.69 
 
 		 248 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  93.24 
 
 		 248 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  90.28 
 
 		 236 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  78.33 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  82.59 
 
 		 246 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  83.64 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  82.14 
 
 		 246 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  83.18 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  83.18 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  83.18 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  83.18 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  47 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  34.98 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0874  hypothetical protein  35.82 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  30.66 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  28.79 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0432  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000142024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0548  protein of unknown function DUF1275  28.97 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1270  protein of unknown function DUF1275  32 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1005  hypothetical protein  26.92 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2000  hypothetical protein  25.35 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1248  hypothetical protein  24.88 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000457718  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1559  hypothetical protein  27.39 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2359  hypothetical protein  24.88 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.26226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  22.46 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  30.32 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.02 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1325  hypothetical protein  24.36 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00182706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  38.04 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  38.67 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  36.49 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  32.61 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  33.68 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  34.72 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>