41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2614 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 224 aa  417  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  99.55 
 
 		 249 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  95.09 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  56.42 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  55.96 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  57.65 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  42.18 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  42.18 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  42.18 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  39.55 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  37.81 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  39.25 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  37.5 
 
 		 658 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  35.42 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  37.09 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  39.06 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  35.78 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  35.82 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  37.7 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  38.64 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  38.18 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  39.53 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  36 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  31.31 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  34.24 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  39.38 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  33.16 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  37.87 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  25 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  32.94 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  31.96 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  31.96 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  33.53 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  36.36 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  36.84 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  29.8 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  29.29 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  34.15 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>