51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1310 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  96.97 
 
 		 231 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  87.45 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  87.62 
 
 		 230 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  86.21 
 
 		 232 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  88.61 
 
 		 230 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  86.64 
 
 		 232 aa  344  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  86.64 
 
 		 232 aa  344  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  57.95 
 
 		 196 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  48.91 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  48.91 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  49.34 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  53.89 
 
 		 247 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  45.37 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  45.67 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  45.67 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  43.54 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  46.23 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  44.93 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  43.5 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  39.15 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  36.82 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  29.22 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  38.51 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  38.51 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  38.51 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  40.72 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  31.46 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  39.9 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  36.36 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  27.75 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  30.26 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  29.17 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  30.8 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  30.66 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  30.66 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0305  hypothetical protein  29.13 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  41.56 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  30.05 
 
 		 386 aa  45.1  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  30.32 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  31.45 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  27.03 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  34.92 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4821  hypothetical protein  26.48 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  30.22 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  27.6 
 
 		 273 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  28.38 
 
 		 262 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  29.63 
 
 		 207 aa  42  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>