22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10129 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  100 
 
 		 259 aa  522  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  56.9 
 
 		 247 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  37.84 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  35.05 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  33.49 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  34.97 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  32.17 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  28.44 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  29.94 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  27.68 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  27.83 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  25.99 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  27.78 
 
 		 658 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  27.53 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  27.68 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  29.38 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  26.86 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  27.43 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  28.07 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  27.12 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  29.15 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  29.38 
 
 		 238 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>