50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1703 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  43.09 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  51.52 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  47.25 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  40.94 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  39.78 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  42.11 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  39.56 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.26 
 
 		 658 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  42.6 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  40.7 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  38.95 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  37.71 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  41.67 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  43.79 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  38.01 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  38.86 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  39.77 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  39.01 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  39.01 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  36.97 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  36.97 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  37.29 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  36.16 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  35.59 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  34.07 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  43.6 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  43.02 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  43.02 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  32.97 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  37.02 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  37.28 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  37.28 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  34.97 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  23.2 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1379  hypothetical protein  25.47 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  27.98 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  35.19 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  35.19 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  35.19 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  29.08 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  32.21 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  32.14 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  29.21 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  29.21 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  28.72 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  31.55 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  28.72 
 
 		 231 aa  42  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  32.86 
 
 		 244 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>