32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2058 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 
230 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7507  protein of unknown function DUF1275  39.89 
 
 
237 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  37.33 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  39.52 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  39.61 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  40.12 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  39.24 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  32.38 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  47.25 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  56.76 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  35.44 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04855  DUF1275 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07550)  32.24 
 
 
331 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  34.81 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  34.81 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  32.78 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  42.11 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  30.67 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3843  protein of unknown function DUF1275  62.5 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  31.67 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  31.93 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  31.93 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  31.64 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  30.17 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  55.81 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  33.15 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  29.3 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  33.15 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  31.79 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  29.73 
 
 
230 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  29.31 
 
 
196 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  29.73 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>