88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1079 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  249  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  48.76 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  44.83 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  48.15 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  45.79 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  47.27 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  43.75 
 
 		 386 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  36.11 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  45.79 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  39.67 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  44.74 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  43.88 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  45.05 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  57.83 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  43.18 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  44.34 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  45.45 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  44.57 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  50.67 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  44.55 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  47.57 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  47.78 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  61.82 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  39.81 
 
 		 386 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  40.59 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  38.89 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  41.33 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  45.57 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  45.33 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  44.74 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  35.87 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  46.97 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  39.39 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  36.49 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  41.43 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  57.53 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  54.9 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  40.26 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  41.67 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  40.98 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  37.7 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  34.67 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  31.88 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  42.55 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  43.06 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  45.3 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  55 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  34.43 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  38.78 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  36.07 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  34.43 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  40.43 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  36.51 
 
 		 116 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  41.07 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  34.67 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  32.47 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  48.89 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  48.89 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  36.51 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  31.82 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  41.07 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  36.23 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  36.51 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  36.51 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  36.51 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  53.57 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  42.5 
 
 		 171 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  36.23 
 
 		 135 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  31.94 
 
 		 121 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>