118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2863 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  222  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  71.88 
 
 		 386 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  71.57 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  59.62 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  60.78 
 
 		 386 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  58.33 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  61.11 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  52.68 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  63.95 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  61.46 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  59.22 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  62.14 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  57.01 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  61.54 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  49.54 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  49.53 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  49.07 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  47.22 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  58.18 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  51.85 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  57.14 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  71.01 
 
 		 75 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  42.98 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  53.49 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  48.31 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  51.16 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  62.38 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  55.32 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  48.19 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  48.62 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  51.02 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  44.94 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  75.81 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  58.02 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  50 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  46.34 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  44.78 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  43.02 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  40.59 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  38.36 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  40.85 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  40.79 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  42.68 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  37.84 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  45.31 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  39.02 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  38.64 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  35.23 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  36.71 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  36.25 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  39.47 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  34.48 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  36.25 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  35.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  40.82 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  32.93 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  34.92 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  39.68 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  34.04 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  34.04 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  37.31 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  33.73 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  33.73 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  33.73 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  42.59 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  38.89 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  38.1 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  30.43 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  30.43 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  35.19 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  36.51 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  36.84 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  40.58 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  28.99 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>