75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4012 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  91.21 
 
 		 91 aa  160  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  69.23 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  54.95 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  56.04 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  55.68 
 
 		 97 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  58.51 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  58.7 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  65.67 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  47.44 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  48.1 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  42.35 
 
 		 386 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  45.57 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  42.17 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  42.22 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  46.38 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  43.18 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  44.78 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  43.04 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  40.85 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  49.21 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  46.97 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  33.75 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  43.21 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  41.25 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  37.04 
 
 		 386 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  43.21 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  41.94 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  36.49 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  36.49 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  41.98 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  38.27 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  25 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  32.43 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  39.66 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  47.17 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  37.18 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  32.88 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  45.57 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  31.94 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  53.49 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  31.94 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  31.94 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  36.49 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  52.08 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  38.16 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  31.94 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  41.18 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  32.39 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  44.64 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  39.51 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  30.56 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  46.94 
 
 		 162 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  40.91 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  34.72 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  28.77 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  38.64 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  48.48 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>