103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2183 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  186  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  89.8 
 
 		 98 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  88.78 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  60.87 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  57.45 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  54.17 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  58.7 
 
 		 91 aa  94  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  52.63 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  52.58 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  47.62 
 
 		 386 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  44.9 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  38.04 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  41.86 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  38.37 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  45.74 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  39.18 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  44.09 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  41.49 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  38.37 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  44.68 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  46.59 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  42.31 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  39.53 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  41.24 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  38.03 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  36.25 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  36.67 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  30.88 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  31.25 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  31.88 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  52.27 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  43.1 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  24.68 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  37.14 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  35.21 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  38.75 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  42.53 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  38.98 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  33.87 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  33.87 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  26.04 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  34.43 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  29.85 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  29.85 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.68 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  29.85 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  46.43 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  46.43 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  44.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  26.32 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  54.9 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  28.38 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  31.34 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  44.29 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  29.23 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  29.23 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  29.23 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  29.23 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  28.38 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  33.85 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  29.85 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  29.23 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  31.88 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  31.88 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  37.78 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  27.94 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  29.73 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  27.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  27.4 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  44.19 
 
 		 138 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  31.82 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0560  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.8331000000000001e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  28.21 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  30.43 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>