121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1508 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 133 aa  266  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  46.99 
 
 		 171 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  47.67 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.83 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  44.58 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  39.53 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  29.6 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  30.22 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  39.53 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  28.99 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  37.04 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  39.02 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  38.55 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  30.19 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  39.02 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  30.61 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  33.65 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  36.59 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  36.59 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  33.7 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  29.9 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  31.17 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  31.17 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.17 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  28.3 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  28.04 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  30.93 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  28.97 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  29.2 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  44.3 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  44.3 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  35.56 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  38.89 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  29.9 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  25.93 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  33.87 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  32.58 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  37.97 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  33.72 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  45.59 
 
 		 386 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  35.71 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  46.81 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  48 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  42.59 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  32.05 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  55.56 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  44.23 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  44 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  32.84 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  48.84 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  30.95 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  51.16 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  33.77 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  41.67 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  52.17 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  38.33 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  51.02 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  48.84 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  48.84 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  38.3 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  47.83 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  46.81 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  47.92 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  44.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  52.63 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  46 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  30.49 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  35.38 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  34.62 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  55.26 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  48.84 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  34.21 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  43.24 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  43.59 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  30.43 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  42  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  30.43 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  34.21 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>