131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0247 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  267  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  79.67 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  81.03 
 
 		 126 aa  199  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  79.49 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  76.07 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  76.07 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  77.57 
 
 		 129 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  54.39 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  49.11 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  47.71 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  43.7 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  45.3 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  45.3 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  49.48 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  55.79 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  44 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  42.59 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  39.5 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  40.43 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  43.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  35.64 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  34.92 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  37.74 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  40.43 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  38.24 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  40.43 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  40.86 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  40.85 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  40.85 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  40.85 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  38.95 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  35.9 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  34.83 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  35.9 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  38.16 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  38.2 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  41.98 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  40.54 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  37.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  37.33 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  42.03 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  41.54 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  33.68 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  30.93 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  32.99 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  32.65 
 
 		 217 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 217 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  32.65 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  32.65 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  27.72 
 
 		 105 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  41.25 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  28.95 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  36 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  29.17 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  26.73 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  26.73 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  26.73 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  25.74 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  34.85 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  26.73 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  25.74 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  31.63 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  31.63 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  31.63 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  40.82 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  31.76 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  26.73 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  45.45 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  36.49 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  32.38 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  32.84 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  29.03 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  33.78 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  30.67 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>