68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4815 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  47.41 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  23.86 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.31 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  30.14 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  33.82 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  35.71 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  47.83 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  32.11 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  28.38 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  31.88 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 217 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  28.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  52.5 
 
 		 75 aa  45.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  40.48 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  37.7 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  45 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  42.86 
 
 		 386 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  47.5 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  45 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  32.81 
 
 		 126 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  40.48 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  45 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  42.55 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  47.5 
 
 		 114 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  35.09 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  25.98 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  57.14 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  36.84 
 
 		 96 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 		 127 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  30.77 
 
 		 155 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  34.25 
 
 		 150 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  38.46 
 
 		 137 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  35.14 
 
 		 118 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  43.9 
 
 		 121 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  32.26 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  57.14 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  36.23 
 
 		 131 aa  41.2  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  33.93 
 
 		 129 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  30.67 
 
 		 120 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  40.35 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  47.06 
 
 		 117 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  41.46 
 
 		 130 aa  40.8  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 130 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>