67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0438 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  46.94 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  47.52 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  40.69 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  41.43 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  40.44 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  36.92 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  34.38 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  32.06 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  36.67 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  37 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  37 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  37 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  30.22 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  30.1 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  34.74 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  30.34 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  29.7 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  34.25 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  32.63 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  48.86 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  28.09 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  32.91 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  26.6 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  35.37 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  28.7 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  32.67 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  25.78 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  28.05 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  39.66 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  35.21 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  48.98 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  25.78 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  32.89 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  36.62 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  29.81 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  38.27 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  55.26 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  28.1 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  33.93 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  45.95 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  38.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  31.58 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  38.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  54.29 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  40.74 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  40.74 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  54.29 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  54.29 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  54.29 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  21.25 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  43.24 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  33.85 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  47.62 
 
 		 131 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  37.04 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>