91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1595 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  95.49 
 
 
133 aa  255  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  75 
 
 
151 aa  216  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  65.99 
 
 
146 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  64.43 
 
 
145 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  64.43 
 
 
145 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  64.43 
 
 
146 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  56.2 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  53.19 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  53.9 
 
 
143 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  59.13 
 
 
116 aa  115  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  34.41 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  35 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  38.3 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  38.38 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  36 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  38.2 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  32.04 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  32.08 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  31.37 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  34.74 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  36.04 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  39.02 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  36.05 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.9 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  39.39 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  31.25 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  35.9 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  30.38 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  28.46 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  26.6 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  30.49 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  46.43 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  34.44 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  32.47 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  35.09 
 
 
182 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  44.44 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  31.68 
 
 
191 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  27.91 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  27.91 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  48.48 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  51.52 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  51.28 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  47.06 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  27.59 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  37.88 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  37.33 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  51.28 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  44.44 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  45.1 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  52.63 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  34.18 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  29.63 
 
 
142 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  35.94 
 
 
126 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  44.23 
 
 
119 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  33.87 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  36.99 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  33.87 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  27.71 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  31.34 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0594  protein of unknown function DUF1232  37.78 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  40.48 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>