108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1552 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
121 aa  231  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  60.53 
 
 
127 aa  153  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  61.86 
 
 
118 aa  153  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  41.96 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  35.83 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  44.9 
 
 
129 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  41.74 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  53.01 
 
 
114 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  40.54 
 
 
386 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  39.32 
 
 
133 aa  87  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  39.81 
 
 
386 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  40.71 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  42.11 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  38.39 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  37.72 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  40.37 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  43.24 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  43.68 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  39.09 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  47.5 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  39.81 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  44.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  41.67 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  48.1 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  40.34 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  43.24 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  44.57 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  39.8 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  33.91 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  39.67 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  52.38 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  40.35 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  40.35 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  31.25 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  30 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  31.03 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  26.97 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  30.23 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  39.29 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  34.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  39.66 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  36.25 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  44 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  32.43 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  52.17 
 
 
131 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  35.29 
 
 
150 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  29.73 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  44.44 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  57.58 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  46.15 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  25.53 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  45.83 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  29.52 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  28.38 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  39.62 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  42.19 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0426  hypothetical protein  48.84 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  31.94 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  31.94 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  42.22 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  47.37 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  29.27 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  31.67 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  29.33 
 
 
126 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  30.43 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  29.69 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  37.14 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  43.48 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  30.43 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  35.06 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  62.07 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  34.85 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  62.96 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>