35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0363 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  160  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  51.52 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  46.97 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  46.97 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  45.31 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  43.94 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  45.45 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  40.54 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  48.21 
 
 		 386 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  40.62 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  39.68 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  38.81 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  40.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  39.39 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  42.42 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  40.58 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  41.79 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  44.07 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  39.39 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  39.13 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  37.5 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  38.71 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  29.41 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  42.37 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  36.92 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  36.62 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  31.75 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>