96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1449 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  241  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  54.47 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  60.19 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  61.11 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  61.29 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  52.25 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  57.14 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  49.56 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  52.89 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  58.14 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  55.95 
 
 		 386 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  50.56 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  47.58 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  47.15 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  67.03 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  56.18 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  45.54 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  52.85 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  46.67 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  49.43 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  44.07 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  49.59 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  45.53 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  68.12 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  48.84 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  50.43 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  44.92 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  56.38 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  54.74 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  40.45 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  37.78 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  36.84 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  38.94 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.08 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  67.16 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  67.16 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  52.69 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  36.62 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  44.59 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  48.39 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  42.39 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  42.67 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  40.22 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  43.28 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  37.04 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  39.08 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  43.1 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  38.75 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  38.75 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  40.68 
 
 		 249 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  41.38 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  42.37 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  55.1 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  39.47 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  39.47 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  39.47 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  39.47 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  52.63 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  53.85 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  38.18 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  60.71 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  44.83 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  51.02 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  35.96 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  48.65 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  35.63 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  35.14 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  40.32 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  35.29 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  36 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  51.28 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  41.82 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1467  protein of unknown function DUF1232  32.1 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0495274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  46.51 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  38.16 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  33.77 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  35.82 
 
 		 124 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  43.18 
 
 		 153 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  39.06 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  39.06 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  32.56 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  31.03 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  42.22 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  46.34 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  32.94 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  36 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>