141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0407 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  89.43 
 
 		 124 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  85.48 
 
 		 124 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  74.59 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  73.98 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  79.34 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  81.31 
 
 		 135 aa  186  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  54.24 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  48.31 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  48.31 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  50.48 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  49.02 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  54.64 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  46 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  44 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  43 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  41.58 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  41.35 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  43.01 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  39.67 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  36.94 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  41 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  38.53 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  36.46 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  39.62 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  39.6 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  40.21 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  39.18 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  39.18 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  39.18 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  41.98 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  32.67 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  39.29 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  42.42 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  40.66 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  34.67 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  37.14 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  37.63 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  37.14 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  30.83 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  33.67 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  32.22 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1268  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 213 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  35.06 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  38.24 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  27.27 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  26.17 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  29.49 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  32.93 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  39.66 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  30.93 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  32.76 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  39.68 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  37.88 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  32.2 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  32.05 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  32.61 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  34.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  29.76 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  35.8 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  24.59 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  24.27 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  30.26 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  30.26 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  32.1 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>