119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2125 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  291  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  54.74 
 
 
150 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  47.26 
 
 
151 aa  147  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  49.59 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  51.18 
 
 
152 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  48.55 
 
 
148 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  40.69 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  34.62 
 
 
138 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.58 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  30.08 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  32.26 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  32.77 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  34.58 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  33.61 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  33.64 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  31.93 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  39.53 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  31.93 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  32.95 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  32.18 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  34.4 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  40.45 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  33.6 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  34.94 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  31.58 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  34.67 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  35 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  32.1 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  30.59 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  44.74 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  28.57 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  42.31 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  40.38 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  26.6 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  30.48 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  32.76 
 
 
131 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  45 
 
 
134 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  38.3 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  30.38 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  35.71 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  29.07 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  20.24 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  42.31 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  39.34 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  43.75 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  43.75 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  36.76 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  43.14 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  46.51 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  37.29 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  32.53 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  37.29 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  29.59 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  32.5 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  32.5 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  27.71 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  45.76 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  41.86 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  27.62 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5029  protein of unknown function DUF1232  35.85 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  43.14 
 
 
323 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  36.67 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  46.51 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  43.4 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  46.51 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  46.51 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  37.29 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  35.48 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4315  protein of unknown function DUF1232  32.91 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4337  protein of unknown function DUF1232  32.91 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  48.84 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  41.51 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  52.94 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  52.94 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  41.51 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  43.9 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  37.93 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  39.22 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  45.45 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  37.93 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  48.72 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  43.18 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  36.99 
 
 
119 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  43.94 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>